Институт активно развивает сотрудничество с ведущими зарубежными научно-исследовательскими и образовательными учреждениями, а также международными организациями и финансовыми институтами.

В частности, ИПМИ осуществляет сотрудничество и реализует совместные проекты с такими международными организациями, как ПРООН, UNDESA, АБР и ВБ, взаимодействует с зарубежными представительствами технического содействия, такими как GIZ, KOICA, JICA, JICE,  и другие. Институтом установлены партнерские отношения с ведущими научными центрами в Южной Корее, ФРГ, РФ и других странах.

Институт работает в тесном взаимодействии с Кабинетом Министров Республики Узбекистан, Олий Мажлисом, Министерством экономики, Министерством финансов, Центральным банком, Министерством труда и социальной защиты населения, Министерством внешних экономических связей, инвестиции и торговли, Торгово-промышленной палатой Узбекистана и другими министерствами и ведомствами.

Кроме того, Институт осуществляет активное сотрудничество с ведущими научно-исследовательскими учреждениями и высшими учебными заведениями страны.